Дальше вы направляете доработку автору. Тот определяет правомерность коррективов и принимает работу на доработку. Она выполняется бесплатно. Но могут быть платные доработки: научный руководитель отступил от утвержденного плана и сказал переделывать содержание первой главы полностью, изменилась тема, теперь надо менять некоторые части работы и т.д. Каждая доработка обсуждается индивидуально. Это естественный рабочий процесс, поэтому не стоит беспокоиться зря.