Подобная ситуация бывает, когда, во-первых, научный руководитель недостаточно ответственно отнесся к проверке работы, во-вторых, рецензент был чрезмерно придирчив к работе. Вы можете отправить доработку к нам, и наши специалисты исправят обнаруженные рецензентом неточности, чтобы вы получили только положительную оценку на защите.