Главное отличие в том, что реферат будет содержать беглый пересказ тематики, в то время как контрольная построена на частных случаях, либо же задачах по данной тематике. Кроме того, в контрольной часто приходится отвечать на контрольные вопросы, в то время, как реферат этого не предполагает.